Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRJQ12913 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRJQ12913 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRJQ12913 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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