Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL1Q08397 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms