Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms