Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRKCDQ05655 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRKCDQ05655 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRKCDQ05655 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRKCDQ05655 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRKCDQ05655 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRKCDQ05655 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms