Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP7AQ04656 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms