Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN2Q02246 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms