Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms