Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK7P50613 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK7P50613 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK7P50613 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms