Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRXP46100 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRXP46100 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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