Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLD1P28340 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms