Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PLNP26678 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms