Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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