Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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