Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms