Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms