Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms