Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
DMDP11532 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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DMDP11532 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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DMDP11532 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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DMDP11532 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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DMDP11532 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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DMDP11532 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DMDP11532 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DMDP11532 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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