Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms