Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms