Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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