Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms