Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PFDN6O15212 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PFDN6O15212 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PFDN6O15212 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PFDN6O15212 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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