Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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