Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms