Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms