Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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