Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAN1Q9Y2M0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms