Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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HDAC6Q9UBN7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC6Q9UBN7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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