Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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USP35Q9P2H5 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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USP35Q9P2H5 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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