Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms