Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031773.1-201ENST00000453579 554 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011306.1-201ENST00000606639 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC239859.5-201ENST00000614100 1232 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms