Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHFRQ96EP1 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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