Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MIS18BP1-201ENST00000310806 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 UNC45B-202ENST00000394570 5638 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CCDC144B-208ENST00000618081 8688 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms