Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ZNF439Q8NDP4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ZNF439Q8NDP4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ZNF439Q8NDP4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ZNF439Q8NDP4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ZNF439Q8NDP4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ZNF439Q8NDP4 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF439Q8NDP4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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