Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms