Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms