Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4L3Q6VB84 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms