Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms