Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms