Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
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