Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms