Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDRF1Q3B7T1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms