Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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