Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms