Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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