Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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