Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLR1Q15399 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms