Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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