Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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