Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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